Unidad de Biopsia Líquida

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La Unidad de Análisis de Biopsia Líquida del IDIS está especializada en el análisis de distintos elementos tumorales presentes en fluídos biológicos, centrándose sobre todo en la caracterización de células tumorales circulantes (CTCs) y DNA tumoral circulante (ctDNA). El interés por el estudio del material tumoral presente fluidos biológicos se ha incrementado de forma exponencial en la última década, principalmente porque es la estrategia menos invasiva y más dinámica de caracterizar los tumores. Por ello, las distintas técnicas de análisis de biopsia líquida se consideran a día de hoy una herramienta clave para mejorar el manejo clínico de los pacientes y comprender mejor los mecanismos moleculares que median la diseminación y progresión tumoral.

Capacidades tecnológicas


Para el análisis de CTCs utilizamos distintas estrategias de aislamiento dependiendo del tumor y el objetivo del estudio. Disponemos de un sistema CellSearch (Menarini), con el que podemos aislar y cuantificar CTCs de pacientes con distintos tipos de tumores sólidos. Este equipo el único aprobado por la FDA para su uso clínico en pacientes con cáncer metastásico de mama, próstata y colon. Disponemos también del sistema de microfluídica Parsortix (Angle) que tiene utilidad para aislar CTCs de forma antígeno independiente. A mayores tenemos experiencia en la utilización de otras estrategias de aislamiento de CTCs como el RosetteSep (StemCell), Metacell o CellCollector (GILUPI), entre otros. Podemos también desarrollar estudios de caracterización genética de la población de CTCs con poblaciones puras o célula única mediante técnicas de micromanipulación.

Para el estudio de ctDNA la plataforma utiliza técnicas altamente sensibles. Por un lado, la tecnología BEAMing con la que tenemos capacidad para determinar mutaciones de gran relevancia clínica como RAS (34 mutaciones puntuales de los exones 2, 3 y 4 de NRAS y KRAS, marcado IVD), EGFR (10 mutaciones incluyendo T790 y C797S, marcado RUO) y BRAF (V600E, marcado RUO). Además de esta tecnología disponemos del sistema Idylla (Biocartis), que nos permite el análisis de mutaciones de RAS/BRAF (IVD) en ctDNA y de un equipo de PCR digital (QX200, Biorad) que nos permite analizar distintas alteraciones genéticas, como mutaciones puntuales y CNVs de un amplio panel de genes.

Cartera de servicios


La plataforma presta los siguiente servicios: aislamiento de plasma y PBMC mediante centrifugación y gradientes de Ficoll; aislamiento de exosomas; aislamiento y cuantificación de CTCs con los sistemas CellSearch, Parsortix CellEllection, Metacell y Cellcollector; aislamiento de DNA/RNA de plasma; estudios de expresión génica mediante qRT-PCR, estudios genéticos para identificar mutaciones mediante BEAMing y PCR digital en ctDNA, cuantificación de cfDNA total en muestras de plasma, estudios proteicos mediante Inmunofluorescencia y purificación a nivel de célula única de muestras enriquecidas en CTCs. Todas estos servicios se pueden llevar a cabo en muestras humanas y en modelos murinos.

Equipo


Investigador principal

Laura Muinelo Romay

Alicia Abalo Piñeiro
Técnico de Laboratorio
Ramón Lago Lestón
Técnico de Laboratorio
Manuel Abreu Rodríguez
Estudiante predoctoral
Oscar Rapado González
Estudiante predoctoral
Patricia Mondelo Macía
Estudiante predoctoral
Roberto Díaz Peña
Investigador postdoctoral

Proyectos de Investigación

Utilidad de la monitorización de BRAF y PD-L1 a través de biopsia líquida para guiar el tratamiento con inhibidores de BRAF en pacientes con melanoma. (Financiado con campaña mecenado) 2018-2020.

Biopsia líquida para la caracterización de c-Met en pacientes metastásicos. (Financiado con campaña mecenado) 2018-2020.

Aproximaciones al manejo de la enfermedad avanzanda en cáncer de endometrio a través de la identificación de biomarcadores en biopsia líquida. ISCIII (PI17/01919). 2019-2020.

Validación clínica del EPiGen kit: Un nuevo test para predecir la respuesta al tratamiento del Cáncer de Pulmón No Microcítico (CPNM). EPIGEN-KIT Ministerio de Economía, Industria y Competitividad. 2017- 2019.

TruePrime-LB: un método innovador para la amplificación de DNA en biopsias líquidas. Ministerio de Economía, Industria y Competitividad (RTC-2016-5092-1). 2016-2018.

Descubrimiento y desarrollo biomarcadores innovadores para medicina personalizada y terapias para el tratamiento eficaz del cáncer de pulmón. Ministerio de Ciencia e Innovación (RTC-2014-1532-1). 2014-2017.

Una nueva biopsia líquida: la saliva como herramienta clínica para el cáncer colorrectal. Financiado parcialmente por Fundación Eugenio Rodríguez Pascual. 2016-2019.

Evaluación clínica de OncoBEAM mediante el panel extendido de 34 mutaciones de RAS: Comparación de la determinación de la mutación RAS en ADN tumoral circulante y en muestra de tejido en pacientes con cáncer colorrectal metastásico. 2017-2018.

Ensayos clínicos/contratos de servicio

Estudio prospectivo de la utilidad de la biopsia líquida como factor predictor y pronóstico en pacientes con carcinoma urotelial metastásico en progresión tras quimioterapia basada en platino” SOG-PLA-2016-01 SOGUG. 2017-2018.

ERMES: ERbitux MEtastatic colorectal cancer Strategy Study; A phase III randomized two arm study with FOLFIRI + Cetuximab until disease progression compared to FOLFIRI + Cetuximab for 8 cycles followed by Cetuximab alone until disease progression in first line treatment of patients with RAS and BRAF wild type metastatic colorectal cancer. 2017-2018.

Análisis del estado de RAS en plasma de pacientes con cáncer colorrectal metastásico para la selección de tratamiento con anti-EGFR. Contrato financiado por MERCK.

Francois-Climent Bidard, Stefan Michiels, Sabine Riethdorf, Volkmar Mueller, Laura J Esserman, Anthony Lucci, Bjørn Naume, Jun Horiguchi, Rafael Gisbert-Criado, Stefan Sleijfer, Masakazu Toi, Jose A Garcia-Saenz, Andreas Hartkopf, Daniele Generali, Françoise Rothé, Jeffrey Smerage, Laura Muinelo-Romay, Justin Stebbing, Patrice Viens et al. CTCs in breast cancer patients treated by neoadjuvant chemotherapy: a meta-analysis. J Natl Cancer Inst. 2018. IF: 12,6/D1

Lousada-Fernández F, Rapado-Gonzalez O, Lopez-Cedrún JL, López-López R, Muinelo-Romay L, Suarez-Cunqueiro MM. Liquid Biopsy in Oral Cancer
Int J Mol Sci. 2018 Jun 8;19(6). pii: E1704. doi: 10.3390/ijms19061704. IF 3,7/Q2

Rapado-González Ó, Majem B, Muinelo-Romay L, Álvarez-Castro A, Santamaría A, Gil-Moreno A, López-López R, Suárez-Cunqueiro MM. Human salivary microRNAs in Cancer. J Cancer. 2018 Jan 6;9(4):638-649. doi: 10.7150/jca.21180 IF: 3,2/Q2

Alonso-Alconada L, Barbazan J, Candamio S, Falco JL, Anton C, Martin-Saborido C, Fuster G, Sampedro M, Grande C, Lado R, Sampietro-Colom L, Crego E, Figueiras S, Leon-Mateos L, Lopez-Lopez R, Abal M. PrediCTC, liquid biopsy in precision oncology: a technology transfer experience in the Spanish health system. Clin Transl Oncol. 2017 Oct 20. doi: 10.1007/s12094-017-1760-9. IF: 2,1/Q3

Climent MÁ, Pérez-Valderrama B, Mellado B, Fernández Parra EM, Fernández Calvo O, Ochoa de Olza M, Muinelo Romay L, Anido U, Domenech M, Hernando Polo S, Arranz Arija JÁ, Caballero C, Juan Fita MJ, Castellano D. Weekly cabazitaxel plus prednisone is effective and less toxic for ‘unfit’ metastatic castration-resistant prostate cancer: Phase II Spanish Oncology Genitourinary Group (SOGUG) trial. Eur J Cancer. 2017 Dec; 87:30-37. IF: 6/Q1

Leon-Mateos L, Casas H, Abalo A, Vieito M, Abreu M, Anido U, Gomez-Tato A, Lopez-Lopez R, Abal M, Muinelo-Romay L. Improving circulating tumor cells enumeration and characterization to predict outcome in first line chemotherapy mCRPC patients. Oncotarget. 2017 May 19;8(33):54708-54721. doi: 10.18632/oncotarget.18025. IF: 5/Q1

Insua YV, Camara J, Vazquez EB, Fernandez A, Rivera FV, Silva MJVV, Barbazan J, Muinelo-Romay L, Folgar SC, Abalo A, Lopez-Lopez R, Abal M, Alonso-Alconada L. Predicting Outcome and Therapy Response in mCRC Patients Using an Indirect Method for CTCs Detection by a Multigene Expression Panel: A Multicentric Prospective Validation Study. Int J Mol Sci. 2017 Jun 13;18(6). pii: E1265. doi: 10.3390/ijms18061265. IF: 3,3/Q2

Figueras A, Alsina-Sanchís E, Lahiguera A, Abreu M, Muinelo-Romay L, Moreno-Bueno G, Casanovas O, Graupera M, Matias-Guiu X, Vidal A, Villanueva A, Viñals F. A role for CXCR4 in peritoneal and hematogenous ovarian cancer dissemination. Mol Cancer Ther. 2017; doi: 10.1158/1535-7163. IF 5,7/Q1

Salvador F, Martin A, López-Menéndez C, Moreno-Bueno G, Santos V, Vazquez-Naharro A, Santamaría PG, Morales S, Dubus P, Muinelo-Romay L, López López R, Tung JC, Weaver VM, Portillo F, Cano A. Lysyl oxidase-like protein LOXL2 promotes lung metastasis of breast cancer. Cancer Res. 2017;77(21):5846-5859; doi: 10.1158/0008-5472.CAN-16-3152; IF=8,6/D1

Vidal J*, Muinelo L*, Dalmases A, Jones F, Edelstein D, Iglesias M, Orrillo M, Abalo A, Rodríguez C, Brozos E, Vidal Y, Candamio S, Vázquez F, Ruiz J, Guix M, Visa L, Sikri V, Albanell J, Bellosillo B, Lopez-Lopez R, Montagut C. Plasma ctDNA RAS mutation analysis for the diagnosis and treatment monitoring of metastatic colorectal cancer patients. Annals Oncol. 2017;28(6):1325-1332. doi: 10.1093/annonc/mdx125 *Co-authorship. IF=11,8/D1

Mariscal J, Alonso-Nocelo M, Muinelo-Romay L, Barbazan J, Vieito M, Abalo A, Gomez-Tato A, Maria de Los Angeles CC, Garcia-Caballero T, Rodriguez C, Brozos E, Baron F, Lopez-Lopez R, Abal M. Molecular Profiling of Circulating Tumour Cells Identifies Notch1 as a Principal Regulator in Advanced Non-Small Cell Lung Cancer. Sci Rep. 2016 Nov 30;6:37820. doi: 10.1038/srep37820. IF=5,2/Q1

León-Mateos L, Vieito M, Anido U, López López R, Muinelo Romay L. Clinical Application of Circulating Tumour Cells in Prostate Cancer: From Bench to Bedside and Back. Int J Mol Sci. 2016 Sep 20;17(9). pii: E1580. IF: 3,2/Q2

Rapado-González Ó, Majem B, Muinelo-Romay L, López-López R, Suarez-Cunqueiro MM. Cancer Salivary Biomarkers for Tumours Distant to the Oral Cavity. Int J Mol Sci. 2016; 17(9). pii: E1531. doi: 10.3390/ijms17091531. IF: 3,2/Q2

Vila A, Abal M, Muinelo-Romay L, Rodriguez-Abreu C, Rivas J, López-López R, Costa C. EGFR-Based Immunoisolation as a Recovery Target for Low-EpCAM CTC Subpopulation. PLoS One. 2016 Oct 6;11(10):e0163705. doi: 10.1371/journal.pone.0163705. IF=3,1/Q1


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